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基于高通量測序探究芒硝用于腸道準備對菌群的影響

戴鵬輝  夏洪芬  唐鳳  甘軻  朱婭  鄧明明  
【摘要】:目的 探究芒硝用于腸道準備對菌群豐度及多樣性影響。方法 共招募10名來自西南醫科大學的健康受試者,收集其腸道準備前一天成型便、服用芒硝腸道準備后第一次成型便及腸道準備后第14d的成型糞便標本,分別記為腸道準備前、腸道準備后及腸道準備14d;提取糞便微生物DNA后對16SrRNAV3~V4區段擴增并進行高通量測序,對測序原始結果進行質控、拼接、操作分類單元(OTUs)聚類后進行后續生物信息學分析;熒光定量PCR測定各樣本16SrRNA載量。結果 與腸道準備前比較,腸道準備后、腸道準備14d的菌群α多樣性(Chao、Shannon、Simpson指數)、β多樣性略有變化,但差異無統計學意義(P005)?;?7%的相似性進行物種注釋并對腸道準備前、后及腸道準備14d的糞便樣本進行微生物物種豐度比較,在門水平上,厚壁菌門(Firmicutes)、變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)及擬桿菌門(Bacteroidetes)豐度有少許變化,差異無統計學意義(P005);在屬水平上(豐度005%),腸道準備后梭菌屬(Clostridium)顯著減少,而內臟擬桿菌屬(Odoribacter)明顯增多,差異均具有統計學意義(P005),而腸道準備14d基本恢復至基線水平;鏈球菌屬(Streptococcus)、擬桿菌屬(Bacteroides)豐度有少許變化,差異無統計學意義(P005)。熒光定量PCR結果表明,腸道準備前、后及腸道準備14d的菌群總量基本持平,差異無統計學意義(P005)。結論 芒硝作為一種天然礦物藥用于腸道準備對菌群豐度及多樣性影響不大。

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